在離子色譜分析中，若水負峰的保留時間與待測離子的保留時間相同或接近時，就會產(chǎn)生干擾。

《水質(zhì) 磷酸鹽的測定 離子色譜法》（HJ 669-2013）的樣品采集與保存規(guī)定，采集的樣品應(yīng)經(jīng)0.45μm微孔濾膜過濾，其濾液不加任何保存劑，收集于聚乙烯或玻璃瓶內(nèi)，在0℃~4℃下可保存48h。

《固定污染源廢氣 硫酸霧的測定 離子色譜法》（HJ 544-2016）樣品運輸和保存規(guī)定，采集的樣品于0℃~4℃冷藏、密封可保存30天。

采用離子色譜法測定水中磷酸鹽，樣品清潔，不存在重金屬、有機物等干擾的水樣，經(jīng)現(xiàn)場過濾后，可直接進樣。

采用《固定污染源廢氣 硫酸霧的測定 離子色譜法》（HJ 544-2016）測定固定污染源廢氣中的硫酸霧時，采樣使用的濾筒對粒徑大于0.3μm的顆粒物阻隔效率不低于99.9%。

為避免色譜柱容量的超載，在分析未知濃度的樣品時，最好先稀釋100倍進樣，或用微量進樣器進樣1-2ul，再根據(jù)所得結(jié)果選擇合適的稀釋倍數(shù)或進樣量，這樣既可以避免色譜柱容量超載，又可以減少強保留組分對柱子的污染。

根據(jù)《水質(zhì) 碘化物的測定 離子色譜法》（HJ 778-2015）的質(zhì)量保證和質(zhì)量控制規(guī)定，每批試劑做一次試劑空白試驗，試劑空白試驗結(jié)果應(yīng)低于方法檢出限。

采用《環(huán)境空氣和廢氣 氯化氫的測定 離子色譜法》（HJ 549-2016）測定固定污染源廢氣中氯化氫時，當廢氣中氯化氫濃度低時，吸收液濃度也可配得低一些，測定時稀釋至與淋洗液濃度相近。

離子色譜法測定環(huán)境空氣和廢氣中氯化氫時，樣品采集完畢，吸收液移入具塞比色管中定容后，即可直接在離子色譜儀上進樣分析。

《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）中環(huán)境空氣顆粒物是指通過采樣裝置，采集在濾膜上的環(huán)境空氣顆粒物（包括TSP、PM10、PM2.5等），不包括環(huán)境空氣降塵。