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用離子色譜法測定廢氣中硫酸霧時，當樣品中含有鈣、鍶、鎂、銅、鐵等金屬陽離子時可以通過陰離子樹脂柱交換處理的方法，除去干擾。
為避免色譜柱容量的超載，在分析未知濃度的樣品時，最好先稀釋100倍進樣，或用微量進樣器進樣1-2ul，再根據所得結果選擇合適的稀釋倍數或進樣量，這樣既可以避免色譜柱容量超載，又可以減少強保留組分對柱子的污染。
采用《環(huán)境空氣和廢氣 氯化氫的測定 離子色譜法》（HJ 549-2016）測定固定污染源廢氣中氯化氫時，當廢氣中氯化氫濃度低時，吸收液濃度也可配得低一些，測定時稀釋至與淋洗液濃度相近。
在離子色譜分析中，進樣體積大，水負峰亦大；淋洗液的濃度越高，水負峰越小。
《環(huán)境空氣和廢氣 氯化氫的測定 離子色譜法》（HJ 549-2016）測定的氯化氫指以氣態(tài)或霧滴形式存在的氯化氫氣體。
采用《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）測定環(huán)境空氣顆粒物中水溶性陰離子時，若空白濾膜中待測離子含量高出方法檢出限時應棄去不要，重新取一張濾膜分析。
采用《環(huán)境空氣和廢氣 氯化氫的測定 離子色譜法》（HJ 549-2016）測定環(huán)境空氣和廢氣中氯化氫時，每次采集樣品應至少帶兩套全程序空白樣品。將同批次裝好吸收液的吸收瓶帶至采樣現場，不與采樣器連接，采樣結束后帶回實驗室待測。
《固定污染源廢氣 硫酸霧的測定 離子色譜法》（HJ 544-2016）樣品運輸和保存規(guī)定，采集的樣品于0℃~4℃冷藏、密封可保存30天。
《水質 無機陰離子（F-、Cl-、NO-2、Br-、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO42-4）的測定 離子色譜法》（HJ 84-2016）樣品的采集和保存規(guī)定，采集的樣品應盡快分析。若不能及時測定，于4℃以下冷藏、避光保存，測定前過濾。
《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）適用于環(huán)境空氣顆粒物（包括TSP、PM10、PM2.5、降塵等）中水溶性陰離子的測定，也適用于在特殊天氣下，采集的顆粒物（如沙塵氣溶膠和沙塵暴降塵）樣品的分析。