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《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）的樣品運輸和保存規(guī)定，環(huán)境空氣顆粒物濾膜樣品在運輸和保存時應存放于濾膜盒中，避免折疊或擠壓；并在無刺激性氣體、避免陽光照射的環(huán)境條件下，置于4℃以下保存。
《環(huán)境空氣和廢氣 氯化氫的測定 離子色譜法》（HJ 549-2016）規(guī)定，測定氯化氫所配的試劑均貯存于玻璃瓶中。
《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）的樣品運輸和保存規(guī)定，環(huán)境空氣降塵樣品置于樣品瓶中，在干燥器內(nèi)保存。
《水質(zhì) 無機陰離子（F-、Cl-、NO-2、Br-、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO42-4）的測定 離子色譜法》（HJ 84-2016）質(zhì)量保證和質(zhì)量控制規(guī)定，空白試驗結(jié)果應低于方法檢出限，否則應查明原因，重新分析直至合格之后才能測定樣品。
在離子色譜分析中，進樣體積大，水負峰亦大；淋洗液的濃度越高，水負峰越小。
在離子色譜分析中，若水負峰的保留時間與待測離子的保留時間相同或接近時，就會產(chǎn)生干擾。
為避免色譜柱容量的超載，在分析未知濃度的樣品時，最好先稀釋100倍進樣，或用微量進樣器進樣1-2ul，再根據(jù)所得結(jié)果選擇合適的稀釋倍數(shù)或進樣量，這樣既可以避免色譜柱容量超載，又可以減少強保留組分對柱子的污染。
用離子色譜法測定廢氣中硫酸霧時，當樣品中含有鈣、鍶、鎂、銅、鐵等金屬陽離子時可以通過陰離子樹脂柱交換處理的方法，除去干擾。
離子色譜法測定無機陰離子時，不被色譜柱保留或弱保留的陰離子干擾F-和Cl-測定時，用強淋洗液進行洗脫。
采用《固定污染源廢氣 硫酸霧的測定 離子色譜法》（HJ 544-2016）測定固定污染源廢氣中的硫酸霧時，采樣使用的石英纖維濾筒無需前處理。